老鼠的20对染色体上共有约25亿个碱基对，与人类23对染色体上的29亿个碱基对相称接近。两个物种的基因数量大约都是3万个，相同基因达到99%。通过对比老鼠与人类的基因图谱，研究职员已经确认了1200个新的人类基因和9000个新的老鼠基因。

目前，这份研究成果中的小家鼠基因组约95%的内容，将向全世界科研职员免费公然，让大家共享。完整的老鼠基因组图谱于2005年完成。

因为繁殖速度快、轻易饲养，所以老鼠是生物和医学实验中的重要模式实验动物。人类遗传疾病基因研究专家、中国协和医科大学沈岩教授以为，老鼠基因图谱破解后揭示出的老鼠与人类基因的高度相似性，使得科学家可以将老鼠与人类基因进行对比研究，尽快找出那些引发人类癌症、心脏病、艾滋病等各种疾病的基因。